RESUMEN
Este artículo presenta un análisis dinámico y estructural del paisaje de atractores en dos redes reguladoras de genes vinculadas con el desarrollo embrionario de erizos de mar: el endodermo y el esqueleto larval. Se utilizan modelos booleanos para simular la dinámica y se generan los diagramas de transición correspondientes. A partir de muestras aleatorias de condiciones iniciales, se identifican atractores de periodo dos en todos los casos. Se examinan la profundidad de las trayectorias, el tamaño de las cuencas de atracción y la estructura de comunidades en las componentes atractoras. Se observa que los atractores dominantes concentran la mayor parte de las trayectorias y presentan comunidades más extensas, mientras que los menos frecuentes están asociados con trayectorias más simples. La elevada proporción de interacciones activadoras y módulos de interacción en ambas redes sugiere una organización topológica que favorece la convergencia hacia estados cíclicos estables. Estos resultados apoyan la hipótesis de que la estructura de las redes génicas está moldeada por presiones evolutivas que promueven comportamientos dinámicos robustos y funcionales durante el desarrollo embrionario.
ABSTRACT
This article presents a dynamic and structural analysis of the attractor landscape in two gene regulatory networks involved in sea urchin embryonic development: the endoderm and the larval skeleton. Boolean models are used to simulate the system’s dynamics and to generate the corresponding transition diagrams. Based on random samples of initial conditions, all identified attractors exhibit a period-two cyclic behavior. The study examines trajectory depth, basin sizes, and the community structure within attractor components. Dominant attractors concentrate most trajectories and form larger communities, while less frequent ones are associated with simpler, more direct dynamics. The high proportion of activating interactions and the presence of multiple interaction modules suggest a topological organization that promotes convergence to stable cyclic states. These findings support the hypothesis that gene network structures are shaped by evolutionary pressures to ensure robust and functional dynamics during embryonic development.